Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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RTL8BQ17RB0 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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RTL8BQ17RB0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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RTL8BQ17RB0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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RTL8BQ17RB0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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RTL8BQ17RB0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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