Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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