Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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LAMA3Q16787 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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