Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 PLSCR2-205ENST00000497985 1441 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AL157871.5-201ENST00000555212 533 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 FAM228B-205ENST00000611127 975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AP001793.2-201ENST00000580267 780 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 VN1R11P-201ENST00000407795 868 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
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