Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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ECM1Q16610 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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