Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
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