Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms