Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
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DDB1Q16531 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
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DDB1Q16531 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
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DDB1Q16531 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
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DDB1Q16531 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
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DDB1Q16531 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
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