Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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TNXAQ16473 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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TNXAQ16473 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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TNXAQ16473 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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TNXAQ16473 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
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TNXAQ16473 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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TNXAQ16473 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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TNXAQ16473 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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TNXAQ16473 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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TNXAQ16473 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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TNXAQ16473 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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