Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
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