Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms