Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
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