Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms