Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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