Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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HERPUD1Q15011 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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HERPUD1Q15011 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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HERPUD1Q15011 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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HERPUD1Q15011 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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