Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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COL19A1Q14993 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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COL19A1Q14993 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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COL19A1Q14993 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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COL19A1Q14993 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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COL19A1Q14993 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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COL19A1Q14993 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
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COL19A1Q14993 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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COL19A1Q14993 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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COL19A1Q14993 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
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COL19A1Q14993 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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COL19A1Q14993 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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COL19A1Q14993 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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COL19A1Q14993 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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COL19A1Q14993 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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