Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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