Protein–RNA interactions for Protein: Q14517

FAT1, Protocadherin Fat 1, humanhuman

Predictions only

Length 4,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT1Q14517 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms