Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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COL9A2Q14055 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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COL9A2Q14055 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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