Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H2Q13888 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms