Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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