Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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