Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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TUBB3Q13509 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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TUBB3Q13509 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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