Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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