Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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TRAF3Q13114 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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