Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms