Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms