Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms