Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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FOXC1Q12948 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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