Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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