Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC10A2Q12908 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms