Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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