Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms