Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms