Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms