Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms