Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms