Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms