Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms