Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
RPS29P62273 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
RPS29P62273 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
RPS29P62273 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
RPS29P62273 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
RPS29P62273 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
RPS29P62273 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
RPS29P62273 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
RPS29P62273 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RPS29P62273 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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