Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms