Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP9P55211 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP9P55211 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP9P55211 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP9P55211 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP9P55211 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP9P55211 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP9P55211 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP9P55211 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP9P55211 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP9P55211 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP9P55211 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP9P55211 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP9P55211 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP9P55211 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP9P55211 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP9P55211 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP9P55211 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP9P55211 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP9P55211 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP9P55211 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP9P55211 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP9P55211 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP9P55211 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP9P55211 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP9P55211 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP9P55211 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP9P55211 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP9P55211 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP9P55211 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP9P55211 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP9P55211 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP9P55211 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP9P55211 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP9P55211 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP9P55211 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP9P55211 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP9P55211 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP9P55211 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP9P55211 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP9P55211 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP9P55211 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP9P55211 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP9P55211 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP9P55211 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP9P55211 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP9P55211 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP9P55211 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP9P55211 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP9P55211 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP9P55211 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP9P55211 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP9P55211 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP9P55211 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP9P55211 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP9P55211 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP9P55211 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP9P55211 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP9P55211 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP9P55211 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP9P55211 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms