Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHBP55084 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHBP55084 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHBP55084 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHBP55084 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHBP55084 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHBP55084 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHBP55084 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHBP55084 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHBP55084 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHBP55084 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHBP55084 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHBP55084 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHBP55084 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHBP55084 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHBP55084 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHBP55084 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHBP55084 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHBP55084 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHBP55084 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHBP55084 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHBP55084 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHBP55084 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHBP55084 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHBP55084 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHBP55084 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHBP55084 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHBP55084 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHBP55084 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHBP55084 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHBP55084 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHBP55084 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHBP55084 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHBP55084 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHBP55084 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HADHBP55084 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHBP55084 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHBP55084 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHBP55084 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHBP55084 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHBP55084 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHBP55084 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHBP55084 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHBP55084 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHBP55084 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHBP55084 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHBP55084 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHBP55084 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHBP55084 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHBP55084 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHBP55084 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHBP55084 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHBP55084 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHBP55084 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHBP55084 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHBP55084 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHBP55084 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHBP55084 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHBP55084 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms