Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUCLG1P53597 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms