Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPNA1P52294 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KPNA1P52294 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms