Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms