Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ME1P48163 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ME1P48163 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ME1P48163 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ME1P48163 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ME1P48163 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ME1P48163 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ME1P48163 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ME1P48163 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ME1P48163 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ME1P48163 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ME1P48163 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ME1P48163 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ME1P48163 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ME1P48163 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ME1P48163 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ME1P48163 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ME1P48163 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ME1P48163 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ME1P48163 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ME1P48163 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ME1P48163 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ME1P48163 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ME1P48163 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ME1P48163 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ME1P48163 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ME1P48163 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ME1P48163 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ME1P48163 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ME1P48163 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ME1P48163 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ME1P48163 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ME1P48163 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ME1P48163 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ME1P48163 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ME1P48163 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ME1P48163 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ME1P48163 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ME1P48163 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ME1P48163 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ME1P48163 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ME1P48163 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ME1P48163 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ME1P48163 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ME1P48163 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ME1P48163 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ME1P48163 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ME1P48163 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ME1P48163 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ME1P48163 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ME1P48163 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ME1P48163 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ME1P48163 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ME1P48163 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ME1P48163 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ME1P48163 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ME1P48163 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ME1P48163 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ME1P48163 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ME1P48163 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ME1P48163 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ME1P48163 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ME1P48163 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ME1P48163 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ME1P48163 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ME1P48163 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ME1P48163 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ME1P48163 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ME1P48163 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ME1P48163 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ME1P48163 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms