Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPOP42166 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPOP42166 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPOP42166 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPOP42166 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPOP42166 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPOP42166 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPOP42166 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPOP42166 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPOP42166 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPOP42166 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPOP42166 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPOP42166 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPOP42166 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPOP42166 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPOP42166 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPOP42166 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPOP42166 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPOP42166 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPOP42166 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPOP42166 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPOP42166 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPOP42166 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPOP42166 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPOP42166 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPOP42166 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPOP42166 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPOP42166 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPOP42166 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPOP42166 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPOP42166 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPOP42166 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPOP42166 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPOP42166 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPOP42166 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPOP42166 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPOP42166 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPOP42166 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPOP42166 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPOP42166 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPOP42166 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPOP42166 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPOP42166 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPOP42166 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPOP42166 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPOP42166 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPOP42166 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPOP42166 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPOP42166 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPOP42166 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPOP42166 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPOP42166 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPOP42166 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPOP42166 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPOP42166 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPOP42166 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPOP42166 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPOP42166 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPOP42166 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPOP42166 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPOP42166 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPOP42166 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPOP42166 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPOP42166 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms