Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms