Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBRP36941 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBRP36941 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBRP36941 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBRP36941 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBRP36941 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBRP36941 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBRP36941 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBRP36941 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBRP36941 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBRP36941 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBRP36941 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBRP36941 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBRP36941 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBRP36941 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBRP36941 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBRP36941 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBRP36941 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBRP36941 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBRP36941 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBRP36941 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBRP36941 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBRP36941 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBRP36941 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBRP36941 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBRP36941 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBRP36941 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBRP36941 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBRP36941 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBRP36941 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBRP36941 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBRP36941 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBRP36941 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBRP36941 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBRP36941 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBRP36941 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBRP36941 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBRP36941 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBRP36941 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBRP36941 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBRP36941 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBRP36941 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBRP36941 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBRP36941 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBRP36941 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
LTBRP36941 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LTBRP36941 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LTBRP36941 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LTBRP36941 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LTBRP36941 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LTBRP36941 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LTBRP36941 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBRP36941 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBRP36941 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBRP36941 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBRP36941 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBRP36941 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBRP36941 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBRP36941 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBRP36941 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBRP36941 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBRP36941 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBRP36941 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBRP36941 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBRP36941 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBRP36941 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBRP36941 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBRP36941 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBRP36941 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBRP36941 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBRP36941 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBRP36941 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBRP36941 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBRP36941 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBRP36941 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBRP36941 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBRP36941 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBRP36941 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBRP36941 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBRP36941 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBRP36941 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBRP36941 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBRP36941 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBRP36941 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBRP36941 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBRP36941 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBRP36941 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBRP36941 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBRP36941 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBRP36941 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBRP36941 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBRP36941 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBRP36941 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBRP36941 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBRP36941 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBRP36941 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBRP36941 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBRP36941 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBRP36941 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBRP36941 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms